W związku z wejściem w życie obowiązkowego KSeF pojawiły się niejasności, co do możliwości wystawiania przez podatników korzystających z podmiotowego zwolnienia z VAT rachunków, zamiast faktur.
Pismem z dnia 12 lutego 2026 r. zwróciliśmy się do MF o wyjaśnienie czy prawidłowe jest stanowisko:
- Ministerstwa Finansów wyrażone w odpowiedzi skierowanej do Stowarzyszenia Księgowych - w zakresie konieczności dokumentowania czynności przez podatnika zwolnionego z VAT fakturą (na żądanie lub dobrowolnie), a nie rachunkiem czy
- Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej zaprezentowane w interpretacji indywidualnej z dnia 27 października 2025 r., nr 0112-KDIL1-3.4012.657.2025.2.MRT - w zakresie możliwości wystawiania rachunków w tradycyjnej formie, niezależnie od systemu e-Faktur.
MF w odpowiedzi z dnia 27 marca 2026 r. potwierdziło aktualność stanowiska wyrażonego w piśmie przekazanym do Stowarzyszenia Księgowych. Zatem podatnik zwolniony nie jest uprawniony do dokumentowania sprzedaży rachunkiem w rozumieniu ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2025 r. poz. 111 ze zm.). Natomiast odnośnie ww. interpretacji indywidualnej wskazano, że została ona zmieniona z urzędu przez Szefa Krajowej Administracji Skarbowej w dniu 5 marca 2026 r. (nr DOP7.8101.6.2026.HEMD). Dodatkowo na temat dokumentowania przez podatników zwolnionych z VAT usług najmu nieruchomości MF podkreśliło, że: "(...) Brak obowiązku wystawienia faktury pomimo zgłoszonego żądania, o którym mowa w art. 106b ust. 3 pkt 1 ustawy nie dotyczy świadczenia usług najmu dokonywanych na rzecz innych podatników. Jeżeli więc podatnik zwolniony będzie wystawiał fakturę za najem, w związku ze zgłoszeniem żądania nabywcy lub dobrowolnie, to z uwagi na to, że kontrahentem jest inny podatnik, powinien wystawić ją w KSeF (...). (...) informujemy, że prawidłowe treści dotyczące rozróżnienia kwestii faktury i rachunku wystawianego na podstawie Ordynacji podatkowej zawiera podręcznik KSeF 2.0 część II - wystawianie i otrzymywanie faktur w KSeF (podkreślenie redakcji) (...)".
